Büyük ekranın yanı sıra ön ve arka kamerada gelişti. Yeni nesil A9 64 Bit işlemci kullanan iPhone 6S Plus, geliştirilmiş yeni nesil kamera kullanılıyor. Ana kamerasının çözünürlüğü 8 megapikselden 12 megapiksele çıkarılan yeni model artık 4K çözünürlüğünde video da kayıt edebiliyor. Ön kamerası 5 megapiksel çözünürlük sunan iPhone 6S Plus modellerinde Retina Flash adı verilen bir aydınlatma teknolojisi kullanılıyor. Bu sayede selfie çekimlerinde ekran parlaklığı anlık olarak artırılarak fotoğraftaki kişilerin yüzlerinin aydınlık olması sağlanıyor.